Остаток стоимости патента к доплате в уведомлении не отражается. В строке 040 нужно отразить его полную стоимость — 49 000. В строке 050 нужно указать сумму взносов, уменьшающих стоимость патента. Например, если ИП без работников и у него только один патент, в строке 050 нужно указать 46 000. Доплата за патент должна составить 3 000. Значит, 3 000 из 6 000 рублей, уплаченных ранее, можно вернуть.

Если ИП с работниками, то уменьшить стоимость патента он может на 50%. Соответственно, в строке 050 следует указать 49 000 * 50% = 24 500. С учетом перечисленных ранее 6 000 доплатить нужно 24 500 — 6 000 = 18 500 рублей.