В данной ситуации переоформлять договор из-за нового отпуска сотрудницы не нужно.
Из вопроса следует, что срочный трудовой договор заключен на период отсутствия основного работника, то есть не указан конкретный срок его действия или дата окончания. В таком случае считается, что срочный трудовой договор заключен на неопределенный срок (статья 58 ТК РФ). То есть момент прекращения договора привязан не ко времени, а к выходу основного сотрудника.

Общий срок двух «декретов» в данном случае роли не играет. Срочный трудовой договор, заключенный на неопределенный срок, может действовать более 5 лет. Он считается действующим до момента выхода на работу человека, которого замещает «срочник» (статья 79 ТК РФ). При этом по прошествии 5 лет он не перестает быть срочным, то есть не происходит его трансформация в бессрочный трудовой договор.