Правила, по которым работают МФЦ, в разных областях РФ различаются. Дело в том, что организацией деятельности таких центров занимаются органы государственной власти конкретного региона. Это следует из п. 2 ст. 15 закона от 27.07.2010 № 210-ФЗ, регламентирующего порядок предоставления государственных и муниципальных услуг. Поэтому точный ответ на свой вопрос Вам лучше узнать в ближайшем МФЦ.

Добавим, что через МФЦ можно сдать только декларацию 3-НДФЛ. Большинство прочих отчетов можно направить в ИФНС лично, почтой, с представителем либо в электронной форме с КЭП (электронной подписью). Декларацию 3-НДФЛ можно направить в ИФНС в электронном виде через госуслуги или личный кабинет физлица.