Абсолютно никаких. Квартира не имеет никакого отношения к ООО, собственность организации указывается в активе баланса. При регистрации имеет значение просто адрес проживания директора или учредителя. В квартиру, где зарегистрировано ООО, даже налоговая проверка не может прийти без согласия проживающих.
Другое дело, что на учредителя ООО в случае банкротства может возлагаться субсидиарная ответственность, но и в этом случае она не может распространяться на квартиру, собственником которой он не является. https://www.regberry.ru/registraciya-ooo/kakuyu-otvetstvennost-neset-uch...