Основное требование для регистрации ООО в жилом помещении - это наличие постоянной прописки в паспорте, а вот быть собственником квартиры необязательно. Временная прописка по этому адресу, при наличии другой постоянной прописки, не позволяет зарегистрировать ООО.
Что касается свидетельства о собственности, то для подтверждения смены фамилии достаточно приложить свидетельство о браке.