Гражданин Таджикистана может стать в РФ индивидуальным предпринимателем практически в том же порядке, что и россиянин. Но нужно иметь документ, подтверждающий легальное пребывание в стране — вид на жительство или разрешение на временное пребывание.

Полный комплект документов и порядок действий описывается тут. https://www.regberry.ru/registraciya-ip/mozhet-li-inostrannyy-grazhdanin...

Документы должны быть переведены на русский язык в России, а перевод — удостоверен нотариусом.

Став ИП, гражданин Таджикистана может выбрать себе налоговый режим, например, УСН или патент.

Что же касается регистрации гражданина Таджикистана самозанятым (или применения им режима НПД в качестве ИП), то такой возможности пока нет. Это доступно для граждан России и иных государств — членов ЕАЭС (Таджикистан в этот союз не входит).