На наш взгляд, посчитать это нарушением налоговая инспекция не должна. ООО обязано сообщить о смене директора в течение 3 дней с даты принятия такого решения собственниками. Если это было сделано, то нарушения со стороны ООО нет. Отказ во внесении сведений в ЕГРЮЛ не влечет отмены того факта, что назначен новый директор.

Можно провести изменения одновременно по форме Р14001, если оформить продажу 100% доли в ООО и смену руководителя. Если делать поэтапно, через ввод нового участника и увеличение уставного капитала, то придётся менять устав, поэтому формы будет две - Р13001 и Р14001. Во втором случае лучше сначала назначить нового руководителя, а потом ввести его в состав участников.

Нет, закон не обязывает менять руководителя после смены участника (что происходит при продаже или дарении ООО). Работодателем остается само общество, поэтому трудовой договор остается в силе. Некорректно в данном случае учитывать часть 1 статьи 75 ТК РФ, потому что собственником имущества также остается ООО. Поэтому, если гендиректор успешно работает, его надо оставлять на той же должности. При этом работодатель, т.е. ООО, вправе позже расторгнуть договор с директором без объяснения причин, это право дано статьей 81 ТК РФ.

Если вы имеете в виду личный кабинет юридического лица, то здесь возникает вопрос о полномочиях нового руководителя. Заявление должно быть подписано ЭЦП нового директора, а не прежнего. При этом удостоверяющие центры выдают подпись новому руководителю только на основании записи ЕГРЮЛ, т.е. уже после зарегистрированной смены директора. Тем не менее, на практике бывают случаи, что проходит регистрация и за подписью прежнего руководителя, потому что несколько лет назад это считалось легитимным, как описано в нашей статье. То есть эта возможность зависит от позиции конкретной ИФНС, поэтому рекомендуем уточнять этот вопрос в местной инспекции.

Форма Р14001 заверяется нотариально во всех случаях и независимо от способа подачи (кроме заверения подписи заявителя ЭЦП). Об этом говорится в нормативных актах: п. 1.18 Приложения N 20 к Приказу ФНС России от 25.01.2012 N ММВ-7-6/25@, п. 1.2 ст. 9 Закона от 08.08.2001 N 129-ФЗ.